El Grupo deCiencia de Datos Biológicos y Redes Complejas forma parte del Departamento de Ingeniería de Sistemas Computacionales y Automatización del Instituto de Investigaciones en Matemáticas Aplicadas y en Sistemas (IIMAS) de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), en la Ciudad de México.

Nuestro trabajo se sitúa en la intersección entre la biología, la ciencia de datos, el aprendizaje automático y el estudio de grafos. Nos enfocamos en el análisis de datos biológicos masivos y en la modelación de sistemas complejos, con el objetivo de comprender cómo las interacciones a nivel de la expresión genética permiten a los organismos responder de manera coordinada a estímulos intra y extracelulares desde una perspectiva de sistemas.

Este enfoque nos ha permitido identificar patrones relevantes en genes y proteínas asociados a diversos procesos biológicos, como la muerte celular programada en hongos, la virulencia en bacterias y hongos, enfermedades como el cáncer de mama y próstata, así como mecanismos conservados en regulación y metabolismo. Adicionalmente, hemos desarrollado nuevos algoritmos que nos permiten identificar y clasificar estas entidades biológicas. Asimismo, estudiamos el efecto de fármacos y la identificación de posibles genes blanco.

De manera complementaria, desarrollamos investigación en el análisis de redes complejas a partir de datos no biológicos, particularmente en el estudio de redes sociales extraídas de textos históricos mediante técnicas de procesamiento de lenguaje natural y teoría de grafos.

Además de la investigación, el grupo tiene como objetivo central la formación de estudiantes en ciencia de datos aplicada a problemas biológicos reales. Promovemos una visión interdisciplinaria, fomentando la autonomía en el manejo de datos, la programación científica, el diseño de algoritmos y el pensamiento crítico para la validación e interpretación de resultados.

El trabajo dentro del grupo se basa en la colaboración, la discusión crítica y la participación activa en todas las etapas del proceso de investigación, desde la formulación de preguntas hasta la comunicación de resultados en informes, tesis y publicaciones científicas.